مصرف زیاد و بیش از اندازه آجیل باعث یبوست می‌شود. بادام یک آجیل سرشار از فیبر است، به نحوی که ۲۳ عدد مغز بادام حدود ۳۰ گرام می‌شود که این مقدار ۳.۵ گرام فیبر دارد. فیبر زیاد می‌تواند باعث یبوست و سایر مشکلات معده مانند اسهال، گرفتگی معده، گاز و غیره شود. مشکلات گوارشی ناشی از خوردن بادام زمانی اتفاق می‌افتد که هنگام خوردن بادام، آب به مقدار زیاد نوشیده نشودگاهی اوقات این پرسش که «آیا مصرف زیاد بادام می‌تواند باعث افزایش وزن شود؟» مطرح می‌شود. مصرف حدود ۲۰ بادام می‌تواند کالری مورد نیاز بدن را تامین کند. اگر میزان وعده‌های غذایی در طول روز کافی است، باید کمتر از ۱۰ بادام در طول روز مصرف کرد.
بادام می‌تواند آلرژی ایجاد کند.بادام مانند چهارمغز می‌تواند دربرخی از افراد حساسیت ایجاد کند. بادام دارای پروتئینی به نام «آمندین» است که یک آلرژن به حساب می‌آید. برخی از واکنش‌های آلرژیک مانند تورم زبان، خارش گلو، تورم لب یا دهان و خارش دهان می‌تواند ناشی از مصرف بادام باشد. اگر شخصی تاکنون بادام نخورده باشد، بهتر است خوردن بادام را با سه تا پنج بادام شروع کند تا از آلرژی مطلع شود.
بنابر اعلام دفتر بهبود تغذیه وزارت صحت، مصرف زیاد بادام می‌تواند منجر به سنگ کلیه شود. بادام حاوی اگزالات است که ترکیبات محلول در روده است. مصرف بیش از حد اگزالات می‌تواند به تشکیل سنگ کلیه و شروع نارسایی کلیه کمک کند.
بادام می‌تواند باعث مصرف بیش از حد ویتامین E شود. بادام دارای ویتامین E و به همین دلیل برای صحت جلد مفید است. هنگام استفاده از مواد غذایی غنی از ویتامین E یا مکمل‌های ویتامین E نباید در مصرف بادام زیادی‌روی کرد. ویتامین E اضافی می‌تواند در انعقاد خون اختلال ایجاد کند و باعث خونریزی شود.
